为了使微耕机保持性能，新购微耕机必须进行磨合，使用中的微耕机必须进行定期保养与维护。磨合新购的微耕机开始使用时是磨合阶段，油门不能开得太大，发动机必须中速运行（用档耕作），在运转12小时后，趁热机状态卸下发动机曲轴箱的放油螺塞，放出机油，然后再将螺塞拧紧，从注油口加入足量的新机油，同时也更换传动箱的齿轮油，微耕机工作与传动箱的磨损，致使发动机启动困难，油耗增加，马力下降，严重者造成机器损坏。
保养每天保养检查燃油箱的燃油、发动机的机油和传动箱的齿轮油，若是水冷式发动机，还要检查水箱中的冷却水。检查并调整皮带松紧度。清除表面油污、泥土及杂草等。检查并紧固各部连接螺栓及轴销。小时的保养除完成每天保养项目外，还应完成下列项目：更换发动机机油；<清除机火化塞电极积炭，调整火化塞间隙，毫米108毫米；检查并调整气门间隙（需在冷机状态时进行调整）。机：进气门间隙毫米毫米，排气门间隙毫米毫米
操作前期有三个准备工作,即选择配套的机器物具;检查传送箱、燃油箱、传送箱里的油料，和水箱中的水位:调整油门、离合器的拉线，还有手扶架高度、耕深和三角皮带等。在我们需要启动微耕机的时候，先在机启动前打开电锁,然后将档位调至空档,并且将水箱开关处调成滴水状态。接下来踩下启动阀，注意认真辨别发动机的运转声音和它排出的颜色，当操作人确定微耕机的发动机正常。